Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP18Q9UMW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP18Q9UMW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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