Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNPO2Q9UMS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms