Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF19Q9UMS4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms