Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MED23Q9ULK4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED23Q9ULK4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED23Q9ULK4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms