Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms