Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPC1L1Q9UHC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NPC1L1Q9UHC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms