Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms