Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRD1Q9P1U0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNRD1Q9P1U0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms