Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L1Q9P0L9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L1Q9P0L9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms