Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms