Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN1

IL1RAPL1, Interleukin-1 receptor accessory protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPL1Q9NZN1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPL1Q9NZN1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL1RAPL1Q9NZN1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPL1Q9NZN1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms