Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRN3Q9NYV6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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