Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms