Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAK1IP1Q9NWT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAK1IP1Q9NWT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAK1IP1Q9NWT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAK1IP1Q9NWT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAK1IP1Q9NWT1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms