Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD4Q9NVD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD4Q9NVD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD4Q9NVD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms