Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GINM1Q9NU53 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms