Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF146Q9NTX7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF146Q9NTX7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF146Q9NTX7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms