Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
EMILIN3Q9NT22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMILIN3Q9NT22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms