Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP7BPQ9NSQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms