Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS4Q9NRS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms