Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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