Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms