Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREM1Q9NP99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREM1Q9NP99 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms