Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMURF1Q9HCE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMURF1Q9HCE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms