Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB17Q9H0T7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB17Q9H0T7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms