Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL4Q9C0H6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL4Q9C0H6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL4Q9C0H6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms