Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC2Q9C0B9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms