Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms