Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 703.7 ms