Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC2P3Q9BVR0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC2P3Q9BVR0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms