Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIFC3Q9BVG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFC3Q9BVG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFC3Q9BVG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFC3Q9BVG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFC3Q9BVG8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms