Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms