Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP6Q9BRS8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms