Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGME1Q9BQP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.6 ms