Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPIN3Q9BQK8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPIN3Q9BQK8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms