Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms