Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms