Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP2Q99959 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms