Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BARD1Q99728 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BARD1Q99728 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms