Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGREF1Q99674 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGREF1Q99674 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGREF1Q99674 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGREF1Q99674 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGREF1Q99674 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms