Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms