Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC5LQ99459 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC5LQ99459 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms