Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SIN3AQ96ST3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIN3AQ96ST3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms