Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

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Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HMCN1Q96RW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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