Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP5Q96RT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP5Q96RT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms