Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX22Q96L94 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX22Q96L94 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms