Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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RNF185Q96GF1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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