Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELP4Q96EB1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.4 ms