Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXorf40BQ96DE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXorf40BQ96DE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms