Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAF2Q96CS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms